O CIDEA tem por missão desenvolver actividades de investigação e desenvolvimento de espécies autóctones visando o estudo, a protecção, a defesa e a reposição dos habitats e ecossistemas promotores da biodiversidade e da preservação da biosfera.
O CIDEA dedica-se ainda à produção e difusão de conteúdos temáticos e explicativos, à realização de eventos na forma de palestras, seminários, campanhas ou outras tipologias, visando uma pedagogia sobre as questões da conservação da natureza e do desenvolvimento social, económico e cultural.
O CIDEA promove ainda a interligação com entidades externas, num espírito de cooperação e apoio mútuo, dando resposta às questões das responsabilidades sociais e ambientais das empresas.